BlankBio:以AI驱动RNA序列设计,革新下一代疗法开发
BlankBio的联合创始人Phil、Ian和Jonny正在构建一个基于RNA基础模型的计算工具包,旨在革新疗法的开发。该平台的核心是利用自监督学习(SSL)技术训练RNA嵌入模型,以解决当前mRNA序列设计中的瓶颈。
当前,mRNA疗法的设计过程高度依赖于科学家手动编辑序列并进行反复试验,这种低效的“试错法”如同在早期计算时代编写汇编代码。BlankBio的解决方案是创建一个高层级的抽象接口,让生物学家能以更直观的方式设计具有特定功能的mRNA序列,例如设定其在体内的半衰期或靶向特定细胞类型。
BlankBio的Orthrus模型,一个拥有1000万参数的模型,在4个GPU上仅训练14小时,其在mRNA半衰期预测等任务上的表现已超越了参数量达400亿、在1000个GPU上训练一个月的Evo2模型。这一成就得益于其采用的联合嵌入架构和对比学习方法,而非简单的序列预测,从而更有效地捕捉了RNA序列的功能属性。
BlankBio的愿景是为RNA设计领域带来类似编译器从汇编语言解放程序员的效率提升。通过不断优化训练算法、扩大预训练数据集并利用参数规模化,BlankBio致力于实现更精确、更高效的mRNA疗法设计,目前已与多家早期生物技术公司开展试点合作,其开源模型也获得了Sanofi和GSK等公司的应用。
Launch HN: BlankBio (YC S25) - Making RNA Programmable | Hacker News
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